Protein–RNA interactions for Protein: K7N5P2

Gm3402, Predicted gene 3402, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3402K7N5P2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3402K7N5P2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3402K7N5P2 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms