Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccer2J3QPU5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccer2J3QPU5 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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