Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm11236J3QMS7 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Gm11236J3QMS7 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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Gm11236J3QMS7 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Gm11236J3QMS7 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Gm11236J3QMS7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Gm11236J3QMS7 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Gm11236J3QMS7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm11236J3QMS7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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