Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm21818J3KMS6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms