Protein–RNA interactions for Protein: F6ZIS7

Rarres1, Retinoic acid receptor responder (tazarotene-induced) 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rarres1F6ZIS7 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Rarres1F6ZIS7 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rarres1F6ZIS7 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms