Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Zfp54-202ENSMUST00000165230 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Myo6-201ENSMUST00000035889 7871 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Tenm2-202ENSMUST00000102801 9908 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Erbb4-202ENSMUST00000121473 12037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Chd8-212ENSMUST00000200169 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Zfp532-201ENSMUST00000049016 5503 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Gm20538F6Z9R1 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Heatr6-201ENSMUST00000001002 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Upf3b-201ENSMUST00000076265 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Fbxo32-201ENSMUST00000022986 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Ctsl-205ENSMUST00000222517 6168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Mcc-201ENSMUST00000089874 7858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Gm20538F6Z9R1 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms