Protein–RNA interactions for Protein: F6SG70

Gm28374, Predicted gene 28374 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28374F6SG70 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 0610040B10Rik-203ENSMUST00000198455 1643 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Gm9520-201ENSMUST00000209460 1253 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm28374F6SG70 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms