Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms