Protein–RNA interactions for Protein: E9Q658

Pate1, Prostate and testis-expressed 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate1E9Q658 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms