Protein–RNA interactions for Protein: E9Q501

Gm2237, Predicted gene 2237, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2237E9Q501 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2237E9Q501 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2237E9Q501 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm2237E9Q501 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2237E9Q501 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2237E9Q501 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2237E9Q501 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2237E9Q501 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2237E9Q501 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2237E9Q501 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2237E9Q501 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2237E9Q501 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2237E9Q501 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2237E9Q501 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2237E9Q501 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm2237E9Q501 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm2237E9Q501 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm2237E9Q501 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm2237E9Q501 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm2237E9Q501 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm2237E9Q501 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm2237E9Q501 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm2237E9Q501 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm2237E9Q501 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms