Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Krt78E9Q0F0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms