Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ddx60E9PZQ1 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms