Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc8D3YZV8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms