Protein–RNA interactions for Protein: D3YWJ0

Nuggc, Nuclear GTPase SLIP-GC, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NuggcD3YWJ0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NuggcD3YWJ0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NuggcD3YWJ0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NuggcD3YWJ0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NuggcD3YWJ0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NuggcD3YWJ0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NuggcD3YWJ0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NuggcD3YWJ0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NuggcD3YWJ0 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NuggcD3YWJ0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NuggcD3YWJ0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NuggcD3YWJ0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NuggcD3YWJ0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NuggcD3YWJ0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NuggcD3YWJ0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NuggcD3YWJ0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms