Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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Rfx8D3YU81 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Rfx8D3YU81 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Rfx8D3YU81 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Rfx8D3YU81 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Rfx8D3YU81 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Rfx8D3YU81 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Rfx8D3YU81 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rfx8D3YU81 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rfx8D3YU81 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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