Protein–RNA interactions for Protein: C0HKC9

Smok3b, Sperm motility kinase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok3bC0HKC9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smok3bC0HKC9 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smok3bC0HKC9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms