Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Brpf3B2KF05 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms