Protein–RNA interactions for Protein: A2A6C4

Sppl2c, Signal peptide peptidase-like 2C, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl2cA2A6C4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sppl2cA2A6C4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sppl2cA2A6C4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sppl2cA2A6C4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sppl2cA2A6C4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sppl2cA2A6C4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sppl2cA2A6C4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sppl2cA2A6C4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sppl2cA2A6C4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sppl2cA2A6C4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sppl2cA2A6C4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sppl2cA2A6C4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sppl2cA2A6C4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sppl2cA2A6C4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sppl2cA2A6C4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sppl2cA2A6C4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sppl2cA2A6C4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sppl2cA2A6C4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sppl2cA2A6C4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sppl2cA2A6C4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sppl2cA2A6C4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sppl2cA2A6C4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sppl2cA2A6C4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sppl2cA2A6C4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sppl2cA2A6C4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sppl2cA2A6C4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sppl2cA2A6C4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sppl2cA2A6C4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sppl2cA2A6C4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sppl2cA2A6C4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sppl2cA2A6C4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sppl2cA2A6C4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sppl2cA2A6C4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms