Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crlf3Q9Z2L7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.2 ms