Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mbd3Q9Z2D8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mbd3Q9Z2D8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms