Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cpne6Q9Z140 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cpne6Q9Z140 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cpne6Q9Z140 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cpne6Q9Z140 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Cpne6Q9Z140 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Cpne6Q9Z140 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Cpne6Q9Z140 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Cpne6Q9Z140 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne6Q9Z140 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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