Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sema4fQ9Z123 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms