Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTU3

Scn8a, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn8aQ9WTU3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn8aQ9WTU3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms