Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Nek3Q9R0A5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nek3Q9R0A5 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms