Protein–RNA interactions for Protein: Q9R061

Nubp2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, mousemouse

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp2Q9R061 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Nubp2Q9R061 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nubp2Q9R061 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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