Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a4Q9QZR9 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms