Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Copg1Q9QZE5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms