Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Six6Q9QZ28 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Six6Q9QZ28 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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