Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cbx8Q9QXV1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cbx8Q9QXV1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms