Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim44Q9QXA7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim44Q9QXA7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim44Q9QXA7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim44Q9QXA7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim44Q9QXA7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim44Q9QXA7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim44Q9QXA7 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim44Q9QXA7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim44Q9QXA7 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim44Q9QXA7 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim44Q9QXA7 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim44Q9QXA7 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim44Q9QXA7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim44Q9QXA7 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim44Q9QXA7 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim44Q9QXA7 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim44Q9QXA7 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim44Q9QXA7 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim44Q9QXA7 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim44Q9QXA7 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim44Q9QXA7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim44Q9QXA7 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim44Q9QXA7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim44Q9QXA7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim44Q9QXA7 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim44Q9QXA7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim44Q9QXA7 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim44Q9QXA7 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim44Q9QXA7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim44Q9QXA7 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim44Q9QXA7 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim44Q9QXA7 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trim44Q9QXA7 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trim44Q9QXA7 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trim44Q9QXA7 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trim44Q9QXA7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Trim44Q9QXA7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trim44Q9QXA7 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trim44Q9QXA7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trim44Q9QXA7 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trim44Q9QXA7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trim44Q9QXA7 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trim44Q9QXA7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim44Q9QXA7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim44Q9QXA7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim44Q9QXA7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim44Q9QXA7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim44Q9QXA7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim44Q9QXA7 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim44Q9QXA7 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim44Q9QXA7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim44Q9QXA7 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim44Q9QXA7 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim44Q9QXA7 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim44Q9QXA7 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim44Q9QXA7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim44Q9QXA7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim44Q9QXA7 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim44Q9QXA7 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim44Q9QXA7 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim44Q9QXA7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim44Q9QXA7 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim44Q9QXA7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim44Q9QXA7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim44Q9QXA7 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim44Q9QXA7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim44Q9QXA7 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim44Q9QXA7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim44Q9QXA7 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim44Q9QXA7 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim44Q9QXA7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim44Q9QXA7 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim44Q9QXA7 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim44Q9QXA7 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim44Q9QXA7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim44Q9QXA7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim44Q9QXA7 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim44Q9QXA7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim44Q9QXA7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim44Q9QXA7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim44Q9QXA7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim44Q9QXA7 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim44Q9QXA7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim44Q9QXA7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim44Q9QXA7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim44Q9QXA7 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim44Q9QXA7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim44Q9QXA7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim44Q9QXA7 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim44Q9QXA7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim44Q9QXA7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim44Q9QXA7 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim44Q9QXA7 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim44Q9QXA7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim44Q9QXA7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim44Q9QXA7 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim44Q9QXA7 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim44Q9QXA7 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim44Q9QXA7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms