Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
DUOX2Q9NRD8 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DUOX2Q9NRD8 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms