Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pard6bQ9JK83 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pard6bQ9JK83 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms