Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpf2Q9JJ80 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms