Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms