Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Tmem239Q9DA47 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Tmem239Q9DA47 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Tmem239Q9DA47 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Tmem239Q9DA47 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Tmem239Q9DA47 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Tmem239Q9DA47 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Tmem239Q9DA47 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Tmem239Q9DA47 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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