Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms