Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg7Q9D906 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms