Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7X1

Kctd4, BTB/POZ domain-containing protein KCTD4, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd4Q9D7X1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kctd4Q9D7X1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kctd4Q9D7X1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kctd4Q9D7X1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kctd4Q9D7X1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kctd4Q9D7X1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kctd4Q9D7X1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kctd4Q9D7X1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kctd4Q9D7X1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kctd4Q9D7X1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kctd4Q9D7X1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kctd4Q9D7X1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kctd4Q9D7X1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kctd4Q9D7X1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kctd4Q9D7X1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kctd4Q9D7X1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kctd4Q9D7X1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kctd4Q9D7X1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kctd4Q9D7X1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kctd4Q9D7X1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kctd4Q9D7X1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kctd4Q9D7X1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Kctd4Q9D7X1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kctd4Q9D7X1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Kctd4Q9D7X1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kctd4Q9D7X1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Kctd4Q9D7X1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kctd4Q9D7X1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kctd4Q9D7X1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kctd4Q9D7X1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Kctd4Q9D7X1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kctd4Q9D7X1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kctd4Q9D7X1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kctd4Q9D7X1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kctd4Q9D7X1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kctd4Q9D7X1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kctd4Q9D7X1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kctd4Q9D7X1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Kctd4Q9D7X1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kctd4Q9D7X1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kctd4Q9D7X1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kctd4Q9D7X1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kctd4Q9D7X1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kctd4Q9D7X1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kctd4Q9D7X1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kctd4Q9D7X1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kctd4Q9D7X1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kctd4Q9D7X1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kctd4Q9D7X1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kctd4Q9D7X1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kctd4Q9D7X1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Kctd4Q9D7X1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kctd4Q9D7X1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kctd4Q9D7X1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kctd4Q9D7X1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kctd4Q9D7X1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kctd4Q9D7X1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Kctd4Q9D7X1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Kctd4Q9D7X1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Kctd4Q9D7X1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kctd4Q9D7X1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Kctd4Q9D7X1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kctd4Q9D7X1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kctd4Q9D7X1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kctd4Q9D7X1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kctd4Q9D7X1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Kctd4Q9D7X1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kctd4Q9D7X1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kctd4Q9D7X1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kctd4Q9D7X1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Kctd4Q9D7X1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Kctd4Q9D7X1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Kctd4Q9D7X1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kctd4Q9D7X1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kctd4Q9D7X1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kctd4Q9D7X1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kctd4Q9D7X1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kctd4Q9D7X1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kctd4Q9D7X1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kctd4Q9D7X1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Kctd4Q9D7X1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kctd4Q9D7X1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kctd4Q9D7X1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kctd4Q9D7X1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Kctd4Q9D7X1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Kctd4Q9D7X1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kctd4Q9D7X1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kctd4Q9D7X1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kctd4Q9D7X1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kctd4Q9D7X1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kctd4Q9D7X1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Kctd4Q9D7X1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kctd4Q9D7X1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kctd4Q9D7X1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kctd4Q9D7X1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kctd4Q9D7X1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kctd4Q9D7X1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kctd4Q9D7X1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kctd4Q9D7X1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kctd4Q9D7X1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms