Protein–RNA interactions for Protein: Q9D287

Bcas2, Pre-mRNA-splicing factor SPF27, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas2Q9D287 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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Bcas2Q9D287 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Bcas2Q9D287 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Bcas2Q9D287 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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