Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms