Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ9

Dnajc18, DnaJ homolog subfamily C member 18, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc18Q9CZJ9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnajc18Q9CZJ9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnajc18Q9CZJ9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnajc18Q9CZJ9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnajc18Q9CZJ9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnajc18Q9CZJ9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc18Q9CZJ9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc18Q9CZJ9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc18Q9CZJ9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc18Q9CZJ9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc18Q9CZJ9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc18Q9CZJ9 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc18Q9CZJ9 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc18Q9CZJ9 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc18Q9CZJ9 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc18Q9CZJ9 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc18Q9CZJ9 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc18Q9CZJ9 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc18Q9CZJ9 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc18Q9CZJ9 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc18Q9CZJ9 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc18Q9CZJ9 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc18Q9CZJ9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc18Q9CZJ9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc18Q9CZJ9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc18Q9CZJ9 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc18Q9CZJ9 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc18Q9CZJ9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc18Q9CZJ9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc18Q9CZJ9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc18Q9CZJ9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc18Q9CZJ9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc18Q9CZJ9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc18Q9CZJ9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc18Q9CZJ9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc18Q9CZJ9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc18Q9CZJ9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc18Q9CZJ9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc18Q9CZJ9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnajc18Q9CZJ9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnajc18Q9CZJ9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnajc18Q9CZJ9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnajc18Q9CZJ9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnajc18Q9CZJ9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnajc18Q9CZJ9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnajc18Q9CZJ9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc18Q9CZJ9 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc18Q9CZJ9 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc18Q9CZJ9 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc18Q9CZJ9 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc18Q9CZJ9 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc18Q9CZJ9 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc18Q9CZJ9 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc18Q9CZJ9 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc18Q9CZJ9 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc18Q9CZJ9 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc18Q9CZJ9 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc18Q9CZJ9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc18Q9CZJ9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc18Q9CZJ9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc18Q9CZJ9 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc18Q9CZJ9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc18Q9CZJ9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc18Q9CZJ9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc18Q9CZJ9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc18Q9CZJ9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc18Q9CZJ9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnajc18Q9CZJ9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc18Q9CZJ9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc18Q9CZJ9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc18Q9CZJ9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc18Q9CZJ9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc18Q9CZJ9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc18Q9CZJ9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc18Q9CZJ9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc18Q9CZJ9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc18Q9CZJ9 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc18Q9CZJ9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc18Q9CZJ9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc18Q9CZJ9 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc18Q9CZJ9 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc18Q9CZJ9 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc18Q9CZJ9 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc18Q9CZJ9 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc18Q9CZJ9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc18Q9CZJ9 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc18Q9CZJ9 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc18Q9CZJ9 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc18Q9CZJ9 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc18Q9CZJ9 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc18Q9CZJ9 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc18Q9CZJ9 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc18Q9CZJ9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc18Q9CZJ9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc18Q9CZJ9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc18Q9CZJ9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc18Q9CZJ9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc18Q9CZJ9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc18Q9CZJ9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnajc18Q9CZJ9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms