Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg3Q9CPX6 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms