Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2a1Q99PM3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms