Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Brms1Q99N20 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms