Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Ms4a4dQ99N05 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Ms4a4dQ99N05 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Ms4a4dQ99N05 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Ms4a4dQ99N05 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Ms4a4dQ99N05 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Ms4a4dQ99N05 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Ms4a4dQ99N05 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Ms4a4dQ99N05 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Ms4a4dQ99N05 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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