Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc8b1Q925Q3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Slc8b1Q925Q3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Slc8b1Q925Q3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Slc8b1Q925Q3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Slc8b1Q925Q3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Slc8b1Q925Q3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Slc8b1Q925Q3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Slc8b1Q925Q3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc8b1Q925Q3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc8b1Q925Q3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc8b1Q925Q3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc8b1Q925Q3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc8b1Q925Q3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc8b1Q925Q3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc8b1Q925Q3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc8b1Q925Q3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc8b1Q925Q3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc8b1Q925Q3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc8b1Q925Q3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc8b1Q925Q3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc8b1Q925Q3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc8b1Q925Q3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc8b1Q925Q3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc8b1Q925Q3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc8b1Q925Q3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc8b1Q925Q3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc8b1Q925Q3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc8b1Q925Q3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc8b1Q925Q3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc8b1Q925Q3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc8b1Q925Q3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc8b1Q925Q3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc8b1Q925Q3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc8b1Q925Q3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc8b1Q925Q3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc8b1Q925Q3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc8b1Q925Q3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc8b1Q925Q3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc8b1Q925Q3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms