Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rnf144aQ925F3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rnf144aQ925F3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rnf144aQ925F3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf144aQ925F3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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