Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tubb6Q922F4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms