Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Odf3Q920N1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms