Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms